I tingsrättshandlingar framgår att det handlar om två målsäganden, ett offer i respektive ärende. Båda är minderåriga, mellan 15-18 år, bekräftar åklagaren.
De misstänkta brotten ska enligt samma uppgifter ha skett i våras.
- Jag kan bekräfta att två personer satt anhållna förra veckan. En för våldtäkt och en för sexuellt ofredande. Det ska ha skett inomhus. Det är två olika brott, säger åklagaren som leder fallet.
Åklagaren vill inte uppge varför man valde att gripa de misstänkta först nu. Båda fotbollsspelarna släpptes senare på fri fot, men är fortsatt misstänkta.
- Jag bedömde inte att det fanns häktningsskäl i nuläget. Jag vill i övrigt inte uttala mig i en pågående förundersökning eller kring de misstänkta eller om andra detaljer.
En ansvarig i den aktuella allsvenska klubben säger:
- Det enda vi vet är det spelarna berättat för oss. De har varit ärliga och transparenta om att de tagits in på förhör. Vi som förening blev kontaktade av polis när de togs in. Vi som klubb följer detta noggrant. Skulle det bli en fällande dom är det emot våra värderingar och grunder. Oavsett är det tråkigt och sorgligt men vi kommer avvakta den rättsliga processen.
Senare under tisdagen meddelade berörd klubb att spelarna i fråga har pausats från träning. Klubben skriver vidare att man nu kommer invänta mer information i ärendet, samt hur åklagaren väljer att gå vidare.
"Föreningen ser naturligtvis allvarligt på anklagelserna och följer ärendena nogsamt. För närvarande råder dock förundersökningssekretess och vi kommer inte att kommentera ärendena vidare för tillfället", skriver klubben.
Enligt klubben nekar spelarna till brott.
Fotbollskanalen har sökt fotbollsspelarnas advokater för en kommentar.