Malmö FF gjorde en strålande match och hade övertaget i första halvlek efter Søren Rieks mål i minut 28. Zenit S:t Petersburg dominerade sedan efter pausen, utan att kunna skapa de stora målchanserna.
Johan Dahlins räddade Artiom Dziubas straff tidigt i andra halvlek och MFF såg ut att gå mot seger efter Dimitri Chistiakovs andra varning i den 86:e minuten. Men på tilläggstid fick Zenit straff igen.
Domaren Andris Treimanis valde att kolla upp Eric Larssons arm i nämnde Dziubas ansikte med hjälp av VAR och dömde straff nummer två till Zenit, som bytte straffskytt och Jaroslav Rakytskyj kvitterade från elva meter.
Efteråt var tränaren Jon Dahl Tomassons känslor tudelade.
- Det var riktigt många VAR-situationer. Det får man handskas med. Killarna gjorde en utmärkt match och spelade riktigt, riktigt snygg fotboll i första halvlek. Det var ett fantastiskt mål vi gjorde. Det var en jättefin stämning på läktarna och jag är stolt över killarna, säger MFF-tränaren och svarar på om han saknar videogranskning i allsvenskan:
- Det är en ganska bra fråga. Våra medlemmar har röstat mot VAR, det respekterar jag eftersom jag verkar i den här klubben. När man spelar i Europa ser man att VAR kan var avgörande, det är något man får man vänja sig vid.
45-åringen tog sig ett snack med domaren Andris Treimanis efter slutsignalen.
- Jag tror att jag sa tack för matchen. Om jag sa något annat har jag glömt det, säger Dahl Tomasson.
Han fick två frågor på presskonferensen om domarnivån, som han valde att inte svara på, med följdfrågan om han fruktar böter från Uefa?
- Jag är inte rädd för böter. Vi har tjänat in 200 miljoner genom att ta oss hit så vi har nog råd att betala böterna, säger Dahl Tomasson.
- Jag har ju sagt att julen kom tidigt till Ryssland.
Tränaren vill hellre fokusera på insatsen som nästan gav lagets första trepoängare i Champions League.
- Det har några hundra miljoner euro mer i budget än oss. Om resultatet var rättvist eller inte törs jag inte säga, säger Dahl Tomasson.
- Jag tycker att Zenit är en utmärkt klubb, som bland annat borde ha vunnit borta mot Chelsea. Jag tycker att vi gjorde en utmärkt första halvlek och är stolt över killarna, men är så klart en smula besviken efter man tappat segern i slutminuterna.
Härnäst väntar Kalmar FF på söndag i allsvenskan för serieledande MFF. Jon Dahl Tomasson tror att kvällens insats kommer stärka laget inför guldstridens upplösning.
- Den ger oss helt säkert en enormt stor boost och självförtroende. Sättet som vi genomförde matchen på är jag väldigt stolt över.
Den här säsongen streamas samtliga matcher från Uefa Champions League exklusivt hos Telia och C More.