David Mitov Nilsson har haft skadeproblem under året, men var i dag tillbaka i IFK Norrköpings mål när Michael Langer ställs åt sidan.
Efter en dryg halvtimmes spel gav Sebastian Andersson Norrköping ledningen framspelad av Christopher Telo.
I den andra halvleken utökade Kalle Holmberg Norrköpings ledning framspelad av Niclas Eliasson, men strax därefter kunde Maksim Maksimov reducera till 1-2 för Trakai på en nick.
2-1 stod sig matchen ut, vilket gör att Norrköping har fördel inför returmötet i Litauen i nästa vecka.
Startelvor:
IFK Norrköping: Mitov Nilsson - Wahlqvist, Johansson, Fjoluson, Telo - Eliasson, Dagerstål, Sjölund, Thorarinsson - Andersson, Holmberg.
Trakai: Sheremeta, Shyshka, Janusevskis, Kruk, Wakili - Silenas, Bychenok, Vorobjovas - Borovskij, Maksimov, Dorley.