Efter en mållös första halvlek öppnade Jose Callejon målskyttet med ett mål som betydde att Napoli utökade sin totala ledning till 5-1.
Därmed blev det lilla hopp Wolfsburg hade inför mötet på San Paolo nu än mindre.
Dryga kvarten senare ökade Dries Mertens på till 2-0 och Rafa Benitez kunde inte annat än att applådera sitt lag som var på väg mot en utklassningsseger sett till hela dubbelmötet.
Den tyska ligatvåan skulle emellertid putsa till siffrorna genom två mål inom loppet av två minuter signerade Timm Klose och Ivan Perisic.
Målen var av akademisk betydelse och Napoli tog sig i slutändan enkelt vidare med totalt 6-3.
Därmed är två Serie A-lag framme i semifinalsspelet i Europa League där semifinalsparen lottas under fredagen.
Lottnignen där Napoli, Fiorentina, Dnipro och Sevilla återfinns börjar 13.00 och du kan följa den live här fotbollskanalen.se.
Så startade lagen:
Napoli: Andujar - Mesto, Albiol, Britos, Ghoulam - Lopez, Inler, Callejon, Hamsik, Mertens - Higuain.
Wolfsburg: Bengalio - Trasch, Naldo, Klose, Rodriguez - Guilavogui, Gustavo, Perisic, Arnold, Caligiuri - Bendtner.