Barcelonas anfallare Ansu Fati, 19, kom nyligen tillbaka från en långtidsskada och är noterad för fyra mål och en assist på nio matcher den här säsongen. Under lördagen stod han för ett mål mot Celta Vigo (3-3) i La Liga, men blev utbytt efter 45 minuters spel.
Efter matchen bekräftade Barcelona att anfallaren dragit på sig en ny skada, men utan att ge besked om hur länge 19-åringen kan tänkas bli borta.
Nu meddelar Spaniens landslag att Fati inte kan komma till spel i VM-kvalet, vilket innebär att anfallaren missar mötet med Sverige på söndag i nästa vecka i Sevilla.
Espanyol-anfallaren Raúl de Tomás, 27, ersätter i stället Fati i truppen. 27-åringen är i höst noterad för sex mål och två assist på elva framträdanden i La Liga.
Barcelona-backen Eric Garcia blev också utbytt i halvtid mot Celta Vigo i lördags och är osäker till den kommande VM-kvalsamlingen. Det spanska landslaget skriver att beslut om mittbackens medverkan i VM-kvalet tas under söndagen.
Spanien ställs på torsdag mot Grekland på bortaplan i kvalet och därefter väntar spel mot Sverige på söndag på hemmaplan i den sista kvalomgången. Spanien är på andra plats med två poäng upp till ettan Sverige i kvalgruppen.